コメントありがとうございます。自分で読み返しても「なんて分かりにくい記事なんだ」と落ち込みますが、お役に立てたのなら嬉しいかぎりです。

そうですね、データベースはリアルタイムに反映されないですね。「ローカルで編集してリモートに送る」という形になるので少しややこしいですが、直接接続できるのはとても便利でした。私も試行錯誤しながらやっております。

（コメントいただいていたのに長く放置状態が続いていてすいませんでした）

現在無事に連携させて開発が進んでます。
Wordpressに入力しても、外部データソースだとFileMakerには即時に反映されないのでスクリプトで「ウインドウ内容の再表示」などを駆使してなんとか頑張ってますが、それは仕方ないと思ってあきらめました。

本当に有用な情報をありがとうございました。

コメントありがとうございます！FileMakerとの連携で日々格闘中で、工夫の仕方も試行錯誤の連続です。書きたい記事もぜんぜん書けていません。

プラグインに関してですが、さすがにこれは難しいと思います。データベースの処理ではなくてPHPとかWordperssコアのプログラミングに関することですから。

一部のプラグインはカスタムタクソノミーやカスタムフィールドに見えない項目を書き加えることで機能を制御するものがあります。こういうのはFileMakerから書き加えたり修正したりすることである程度管理できます。
おっしゃっているプラグインの変更したい部分がどのようなところかわかりませんけど、もしカスタムフィールドに見えない項目を追加するだけのシンプルな機能の部分でしたら少しは使い勝手を良くする方法があるかもしれませんね。

プラグインのオンオフや機能の根深いところはどうしようもありません（というかプログラミングの知識が私にありませんので・・）